地球の開拓船が中央大陸に不時着。その影響で惑星Ziの技術力、軍事力は飛躍的に進歩した。地球人の技術を取り入れて作られたゾイドの力は圧倒的だった。

　それまでのゾイドは完全に旧式化し、両軍は総力をあげて新型ゾイドの開発に取り組み始めた。
　ゾイドの進化により、戦場は陸海空へと大きく広がっていく。
　のどかでさえあったそれまでの戦闘が、苛烈な近代戦へと移行し始めていた。